Bacteria Colonies
生物学者はシークエンシング(塩基配列の解析)のためにDNAをクローンするとき、バクテリアを使います。 クローンする必要があるDNAを注入されたバクテリアを大きな培地(plate)で繁殖させます。 バクテリアは繁殖するにつれて、コロニーを形成しはじめます。 健康なコロニーのバクテリアだけが、シークエンシングに使われます。 そしてここで生物情報学(bioinformatics)をゲームにして、このプロセスを自動化するためのテクノロジーを使います。
培地のスナップショットをピクセルのグリッドで表現します。 あなたは、このグリッドを1-0行列で与えられます。ここで1はバクテリアのセルを0は空白を表します。 我々の目的は一様に成長した健康なバクテリアコロニーのうちで一番大きいものを発見することです。 バクテリアは4つの隣り合ったセルへ成長することができ、バクテリアコロニーは連結したバクテリアの集団です。 健康なコロニーは下の図で示したような形をしています。 ...
CheckiO Extensions allow you to use local files to solve missions. More info in a blog post.
In order to install CheckiO client you'll need installed Python (version at least 3.8)
Install CheckiO Client first:
pip3 install checkio_client
Configure your tool
checkio --domain=py config --key=
Sync solutions into your local folder
checkio sync
(in beta testing) Launch local server so your browser can use it and sync solution between local file end extension on the fly. (doesn't work for safari)
checkio serv -d
Alternatevly, you can install Chrome extension or FF addon
checkio install-plugin
checkio install-plugin --ff
checkio install-plugin --chromium
Read more here about other functionality that the checkio client provides. Feel free to submit an issue in case of any difficulties.
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